Albert Cardona<p>From Josh Moore, German Bioimaging research software engineer and OME and Zarr developer and maintainer:</p><p>🚀 We’re hiring again! Join German BioImaging as a Software Developer!</p><p>💻 Build scalable <a href="https://mathstodon.xyz/tags/bioimaging" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>bioimaging</span></a> solutions</p><p>🌍 Collaborate globally</p><p>🎯 Contribute to open science through <a href="https://mathstodon.xyz/tags/OME" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>OME</span></a> <a href="https://mathstodon.xyz/tags/Zarr" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>Zarr</span></a></p><p>📣 Tell your <a href="https://mathstodon.xyz/tags/NGFF" class="mention hashtag" rel="nofollow noopener" target="_blank">#<span>NGFF</span></a> friends.</p><p>Remote, full-time. Apply by 30 June 2025. All submissions via:<br><a href="https://gerbi-gmb.de/machform/view.php?id=86038" rel="nofollow noopener" translate="no" target="_blank"><span class="invisible">https://</span><span class="ellipsis">gerbi-gmb.de/machform/view.php</span><span class="invisible">?id=86038</span></a></p>
#bioimaging
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In Ep 12 of #spotLights, Jonathan Townson talks to Daniel Booth about his lab's recent #preprints (cell division mechanisms & new bioimaging tools), presented at #biologists100. One was recently published @J_Cell_Sci !
They also explore the value of preprinting for early-career PIs and their teams.
Listen below 
https://youtu.be/Uk5EBqmfFhY
youtu.be- YouTubeEnjoy the videos and music you love, upload original content, and share it all with friends, family, and the world on YouTube.
#MeetOurDataStewards: The NFDI4BIOIMAGE Community Support Taskorce 
No matter your research field, @nfdi4bioimage supports you in managing imaging #data. This process requires not only time and expertise, but also specialists who understand #bioimaging data.
Over the next few months, we will introduce one expert from our Data Steward team each month. We look forward to sharing their exciting projects, publications, and helpful tips with you.
Data Stewards overview: https://nfdi4bioimage.de/about-us/data-stewardship-team/
Efficient, standards-based #bioimaging data management is essential for research and data reuse. Join @nfdi4bioimage's presentation about “A Journey to #FAIR Bioimage Data,” a contribution to @ells_heidelberg's STANDFLOW project webinar series:
July 2, 2025 | 02:30–03:30 pm | Online & Free
Local data management: #OMERO & beyond Annotation: metadata, ontologies, REMBI Linking images with protocols & results Cloud storage: ome.zarr Data publication
Register: https://www.ebi.ac.uk/training/events/journey-fair-bioimage-data/NFDI4B
It was a pleasure to be a speaker at the "Shaping light in space and time for bioimaging" Ph.D. school in Erice! Met a selection of amazing scientists, and had a lot of fun discussing imaging and optics in a great location! #bioimaging #optics
The high degree of heterogeneity in #bioimaging #metadata makes collaboration difficult and often leads to the loss of relevant metadata. In the presentation “Bioimaging Metadata”, which our @nfdi4bioimage colleagues Susanne Kunis and @joshmoore gave a few weeks ago, they discuss the reasons for this heterogeneity and which standards can be used to work towards loss-free and reusable metadata.
They have posted their slides on Zenodo: https://zenodo.org/records/15083018
@nfdi4bioimage experts will share best practices for #FAIR #bioimaging data in the webinar series "How to organise and share my imaging data?" from May 14 to July 2, 2025, organised by the STANDFLOW project and supported by @emblebi. 
May 28: Towards Open and Standardized Imaging Data: An Introduction to Bio-Formats, OME-TIFF, and OME-Zarr | @joshmoore
July 2: A journey to FAIR bioimage data | Christian Schmidt, Tom Boissonnet, Stefanie Weidtkamp-Peters
https://www.ebi.ac.uk/training/events/how-organise-and-share-my-imaging-data/
Continued thread
If you train people in ImageJ, Fiji, whatever, even if it isn't your day job, please let us know, and please share this post! Thanks a ton, we really appreciate it. (2/2) forms.gle/C8dUpg8qZkbD... #bioimaging #microscopy #bioimageanalysis
Open Source Bioimage Analysis ...
Google DocsOpen Source Bioimage Analysis Training SurveyWe are attempting for a publication to estimate the number of biologists who have attended a tutorial or training course in open source bioimage analysis (especially user friendly tools, but anything as long as it's open) in the last 5 years. If you have run one, we'd love to include your stats!
Bioimaging and bioimage analysis friends, some help if you have 2-3 mins; for a paper, we're trying to estimate the number of biologists trained in open source software or tools in the last ~5 years. (1/2) #bioimaging #microscopy #bioimageanalysis
Bluesky SocialBluesky
Want to become part of a team that shapes the future of #bioimaging data management? Apply now for a Research Software Engineering #RSE position at the Max Planck Institute for Evolutionary Biology (https://www.evolbio.mpg.de). More details at https://s.gwdg.de/8D4sMb
www.evolbio.mpg.deStartseiteDas Max-Planck-Institut für Evolutionsbiologie besteht derzeit aus den beiden Abteilungen für Theoretische Biologie und Mikrobielle Populationsbiologie. Es betreibt Grundlagenforschung, um grundsätzliche evolutionsbiologische Prozesse zu erklären wie etwa ökologische Anpassungen, Entstehung der Sexualität oder Evolution von Kooperativität. Die Spannbreite der Arbeiten beinhaltet ökologische, organismische, molekulare und theoretische Ansätze.
Jetzt geht's los mit wine Workshop zu #BioImaging auf den #escitage2025 #GoetheTravels #NFDI4BioImaging #Forschungsdatenmanagement
The Silva unit of INRAE recruits an engineer in biological #imaging using SEM and optical #Microscopes, submissions open until 20 March 2025. More information at https://jobs.inrae.fr/concours/concours-externes-ingenieurs-cadres-techniciens-h-f/ir25-ecodiv-2
more about the Silva unit at : https://eng-silva.nancy.hub.inrae.fr/
Please #Share widely in your #AcademicNetworks
#Microscopy #ElectronMicroscopy #BioImaging #Forests #PlantScience #SciJobs #Vacancy #JobVacancy #JobOpening #JobOpportunity #ResearchJobs #Academia @academicchatter 1/3
INRAE JobsIngénieur-e biologiste en imagerieIR25-ECODIV-2 - Vous intégrerez l'Unité mixte de recherche (UMR) SILVA (INRAE, AgroParisTech, Université de Lorraine). L'unité a pour objectif de développer des travaux pluridisciplinaires sur l'adaptation des écosystèmes forestiers aux changements globaux. Intégrée à SILVA, la plateforme technologique SILVATECH labellisée par INRAE propose des services d'analyses, de développement et de formation à partir d'une gamme d'équipements de haute technologie regroupés dans deux pôles : Isotopie-Chimie (IC) et Imagerie et Mesures Multi-Modales (I3M) que vous intégrerez pour y assurer les missions suivantes :- En collaboration avec les communautés de recherches locales, nationales et européennes, vous mettrez à profit vos connaissances et vos compétences initiales fortes en biologie et physiologie végétale aux échelles fines, pour mieux appréhender et caractériser par imagerie, les réponses physiologiques et anatomiques de l'arbre aux contraintes de son environnement. Dans le cadre du projet de recherche de l'unité SILVA, vous conduirez des travaux permettant d'identifier des marqueurs anatomiques et physiologiques de la tolérance ou de la vulnérabilité de l'arbre aux stress multiples (ex : sécheresse, ennoyage, vent, attaque biotique). Pour ce faire, vous serez chargé-e de développer des méthodologies de microscopie corrélative permettant de combiner les informations biologiques acquises, à partir de différents équipements, sur les mêmes échantillons par des approches multi-échelles et multi-techniques. Ces approches corrélatives permettront de créer des passerelles entre les échelles micro à nanométriques mais aussi de combiner des informations structurales et fonctionnelles voire dynamiques à partir des échantillons observés. Pour ce faire, vous développerez des itinéraires méthodologiques complets et intégrés à partir du large éventail d'équipements récents présents sur le pôle I3M (2 Cryo-MEB équipés en micro-analyse EDS, WDS et RX, un microscope confocal à balayage laser, un microscope à microdissection laser, une station d'imagerie photonique numérique, un multiscanner RX, un système d'imagerie hyperspectrale, divers équipements reposant sur l'utilisation des rayons X ainsi que des équipements de préparations en microscopie, un plateau de préparation en histologie) et dynamiserez les liens entre les approches présentes sur le pôle (densité stomatique, densité des vaisseaux du bois, anatomie quantitative à grande échelle, dendrométrie/chronologie/chimie). - Vous coanimerez le pôle I3M constitué de neuf agents, en assurant des activités telles que la gestion des plannings et activités des agents, le développement et la validation de méthodes, le contrôle et gestion de la maintenance, l'investissement significatif dans la prévision, l'élaboration et la conduite des dossiers stratégiques (achat d'équipement, expertise), l'apport d'expertise au montage de projets et l'application des démarches qualités. Pour mener à bien cette mission, vous travaillerez en relation étroite avec les autres animateurs de pôle et le responsable de la plateforme Silvatech.- Vous coordonnerez une partie du parc d'équipements associé au pôle I3M en collaboration avec leurs responsables techniques.- Vous assurez et/ou coordonnerez la formation de stagiaires/doctorants/post-doc aux techniques et équipements de microscopie dans un cadre local ou national.- Vous vous impliquerez fortement dans les réseaux technologiques (ex : RCCM-RIME, COST COMULIS) afin d'assurer la veille technologique et la valorisation de vos travaux de développement dans ces communautés. Cette valorisation passera également par la rédaction et la participation active à des publications scientifiques aussi bien en biologie qu'en techniques instrumentales.
Repositories are essential for #FAIR data. Our invited speakers Frances Wong from
#OME #IDR & Aybüke Yoldaş from
BioImage Archive present recent developments at
@nfdi4bioimage All-Hands Meeting. We're excited to extend our collaborations FAIR #bioimaging @NFDI
Phd Student Vascular biology zebrafish/mouse
University of Saskatchewan College of Medicine
PhD position in cardiovascular research, Saskatoon, Canada.
See the full job description on jobRxiv: https://jobrxiv.org/job/university-of-saskatchewan-college-of-medicine-27778-phd-student-vascular-biology-zebrafish-mouse/?feed_id=90409
#bioimaging #cardiovascul...
https://jobrxiv.org/job/university-of-saskatchewan-college-of-medicine-27778-phd-student-vascular-biology-zebrafish-mouse/?feed_id=90409
jobRxivPhd Student Vascular biology zebrafish/mousePost a job in 3min, or find thousands of job offers like this one at jobRxiv!